¿Cómo puedo producir parcelas como esta?


Me he encontrado con este tipo de gráfico que realiza agrupamiento jerárquico sobre un conjunto dado de datos de series de tiempo. ¿Puede alguien decirme cómo dibujar tales tramas?

Estoy abierto a implementaciones en R o Javascript, especialmente usando d3.js.

introduzca la descripción de la imagen aquí

Author: Argalatyr, 2012-03-17

1 answers

Siempre puede crear la trama a mano: con gráficos base, el parámetro fig le permite agregar parcelas dentro de otra parcela.

# Sample data
n <- 100
k <- 6
d <- matrix(rnorm(k*n),nc=k)
d[,2] <- d[,1]  # To help check the results
colnames(d) <- LETTERS[1:k]
x <- apply(d,2,cumsum)
r <- hclust(dist(t(d)))
# Plot
op <- par(mar=c(0,0,0,0),oma=c(0,2,0,0))
plot(NA,ylim=c(.5,k+.5), xlim=c(0,4),axes=FALSE)
# Dendrogram. See ?hclust for details.
xc <- yc <- rep(NA,k)
o <- 1:k
o[r$order] <- 1:k
for(i in 1:(k-1)) {
  a <- r$merge[i,1]
  x1 <- if( a<0 ) o[-a] else xc[a]
  y1 <- if( a<0 ) 0 else yc[a]
  b <- r$merge[i,2]
  x2 <- if( b<0 ) o[-b] else xc[b]
  y2 <- if( b<0 ) 0 else yc[b]
  lines( 
    3+c(y1,i,i,y2)/k,
    c(x1,x1,x2,x2),
    lwd=k-i
  )
  xc[i] <- (x1+x2)/2
  yc[i] <- i
}
# Time series
axis(2,1:k,colnames(d)[r$order],las=1)
u <- par()$usr
for(i in 1:k) {
  f <- c(0,3,i-.5,i+.5)
  f <- c( 
    (f[1]-u[1])/(u[2]-u[1]), 
    (f[2]-u[1])/(u[2]-u[1]), 
    (f[3]-u[3])/(u[4]-u[3]), 
    (f[4]-u[3])/(u[4]-u[3])
  )
  par(new=TRUE,fig=f)
  plot(x[,r$order[i]],axes=FALSE,xlab="",ylab="",main="",type="l",col="navy",lwd=2)
  box()
}
par(op)

Dendograma con series temporales

(Después de escribir esto, me doy cuenta de que probablemente es más fácil hacerlo con layout...)

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Author: Vincent Zoonekynd,
Warning: date(): Invalid date.timezone value 'Europe/Kyiv', we selected the timezone 'UTC' for now. in /var/www/agent_stack/data/www/ajaxhispano.com/template/agent.layouts/content.php on line 61
2012-09-30 22:14:37